Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thoc3Q8VE80 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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