Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms