Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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