Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc8Q8VD72 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms