Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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