Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms