Protein–RNA interactions for Protein: Q8K363

Ddx18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx18Q8K363 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ddx18Q8K363 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ddx18Q8K363 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ddx18Q8K363 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ddx18Q8K363 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ddx18Q8K363 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ddx18Q8K363 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ddx18Q8K363 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ddx18Q8K363 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ddx18Q8K363 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx18Q8K363 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms