Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms