Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Abcf3Q8K268 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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