Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms