Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q4Q8HWB2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms