Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms