Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms