Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms