Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sphk1Q8CI15 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sphk1Q8CI15 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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