Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn2Q8CHX7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms