Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms