Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Colec10Q8CF98 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms