Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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