Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms