Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fam228aQ8CDW1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fam228aQ8CDW1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fam228aQ8CDW1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam228aQ8CDW1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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