Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms