Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms