Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7cQ8C6E1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms