Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms