Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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