Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfrp1Q8C4U3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms