Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Iffo1Q8BXL9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Iffo1Q8BXL9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Iffo1Q8BXL9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Iffo1Q8BXL9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Iffo1Q8BXL9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Iffo1Q8BXL9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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