Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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