Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pggt1bQ8BUY9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pggt1bQ8BUY9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pggt1bQ8BUY9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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