Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia2Q8BSS9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia2Q8BSS9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms