Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms