Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik4Q8BMF5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms