Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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