Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Frmd4aQ8BIE6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms