Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdca8Q8BHX3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdca8Q8BHX3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdca8Q8BHX3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdca8Q8BHX3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdca8Q8BHX3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdca8Q8BHX3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdca8Q8BHX3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdca8Q8BHX3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdca8Q8BHX3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdca8Q8BHX3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms