Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas4Q8BGD7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms