Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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H2-M10.2Q85ZW9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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H2-M10.2Q85ZW9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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H2-M10.2Q85ZW9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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H2-M10.2Q85ZW9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H2-M10.2Q85ZW9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H2-M10.2Q85ZW9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H2-M10.2Q85ZW9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H2-M10.2Q85ZW9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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