Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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