Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfascQ810U3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfascQ810U3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfascQ810U3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfascQ810U3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NfascQ810U3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NfascQ810U3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfascQ810U3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NfascQ810U3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NfascQ810U3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NfascQ810U3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfascQ810U3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfascQ810U3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NfascQ810U3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NfascQ810U3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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NfascQ810U3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NfascQ810U3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NfascQ810U3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NfascQ810U3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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