Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms