Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms