Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smim19Q80ZU4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smim19Q80ZU4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms