Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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