Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms