Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM4

Znf579, Zinc finger protein 579, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf579Q80VM4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf579Q80VM4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf579Q80VM4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms