Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttll4Q80UG8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms