Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnQ80U62 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnQ80U62 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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RubcnQ80U62 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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RubcnQ80U62 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnQ80U62 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnQ80U62 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnQ80U62 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnQ80U62 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnQ80U62 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
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RubcnQ80U62 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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RubcnQ80U62 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RubcnQ80U62 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RubcnQ80U62 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RubcnQ80U62 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RubcnQ80U62 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RubcnQ80U62 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RubcnQ80U62 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RubcnQ80U62 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RubcnQ80U62 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnQ80U62 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms