Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rusc2Q80U22 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rusc2Q80U22 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rusc2Q80U22 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rusc2Q80U22 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rusc2Q80U22 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rusc2Q80U22 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rusc2Q80U22 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rusc2Q80U22 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms