Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NischQ80TM9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NischQ80TM9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NischQ80TM9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms